Το Τμήμα Ναυτιλιακών Σπουδών προσφέρει τα ακόλουθα Μεταπτυχιακά Προγράμματα:
- Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών στη Ναυτιλία
- MSc in Shipping Management
- MSc Sustainability and Quality in Marine Industry
- ΔΠΜΣ στη Διοίκηση στη Ναυτική Επιστήμη και Τεχνολογία
- ΠΜΣ Διαχείριση Λιμένων και Παράκτια Οικονομία
- Διδακτορικές Σπουδές
